Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
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