Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATRQ13535 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATRQ13535 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATRQ13535 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATRQ13535 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATRQ13535 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATRQ13535 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATRQ13535 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATRQ13535 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATRQ13535 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATRQ13535 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATRQ13535 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATRQ13535 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATRQ13535 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATRQ13535 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATRQ13535 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATRQ13535 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATRQ13535 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATRQ13535 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATRQ13535 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATRQ13535 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATRQ13535 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATRQ13535 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATRQ13535 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATRQ13535 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATRQ13535 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATRQ13535 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATRQ13535 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATRQ13535 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATRQ13535 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATRQ13535 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATRQ13535 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATRQ13535 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATRQ13535 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATRQ13535 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATRQ13535 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATRQ13535 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATRQ13535 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATRQ13535 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATRQ13535 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATRQ13535 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATRQ13535 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATRQ13535 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATRQ13535 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATRQ13535 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATRQ13535 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATRQ13535 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATRQ13535 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATRQ13535 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATRQ13535 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATRQ13535 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATRQ13535 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATRQ13535 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATRQ13535 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATRQ13535 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATRQ13535 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRQ13535 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRQ13535 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRQ13535 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRQ13535 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRQ13535 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRQ13535 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRQ13535 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRQ13535 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRQ13535 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRQ13535 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRQ13535 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRQ13535 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRQ13535 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRQ13535 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRQ13535 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRQ13535 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRQ13535 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRQ13535 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRQ13535 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRQ13535 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRQ13535 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRQ13535 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRQ13535 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRQ13535 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRQ13535 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRQ13535 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRQ13535 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRQ13535 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRQ13535 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATRQ13535 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATRQ13535 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATRQ13535 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATRQ13535 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ATRQ13535 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATRQ13535 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ATRQ13535 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATRQ13535 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATRQ13535 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ATRQ13535 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ATRQ13535 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ATRQ13535 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATRQ13535 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATRQ13535 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATRQ13535 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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