Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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