Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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