Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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