Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms