Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms