Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms