Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms