Protein–RNA interactions for Protein: Q05513

PRKCZ, Protein kinase C zeta type, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCZQ05513 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKCZQ05513 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKCZQ05513 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKCZQ05513 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKCZQ05513 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKCZQ05513 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKCZQ05513 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKCZQ05513 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKCZQ05513 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKCZQ05513 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKCZQ05513 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKCZQ05513 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKCZQ05513 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKCZQ05513 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKCZQ05513 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKCZQ05513 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKCZQ05513 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKCZQ05513 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKCZQ05513 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKCZQ05513 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKCZQ05513 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKCZQ05513 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKCZQ05513 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKCZQ05513 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKCZQ05513 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKCZQ05513 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKCZQ05513 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKCZQ05513 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKCZQ05513 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKCZQ05513 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKCZQ05513 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKCZQ05513 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKCZQ05513 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKCZQ05513 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKCZQ05513 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKCZQ05513 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKCZQ05513 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKCZQ05513 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKCZQ05513 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKCZQ05513 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKCZQ05513 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKCZQ05513 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKCZQ05513 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKCZQ05513 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKCZQ05513 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKCZQ05513 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKCZQ05513 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKCZQ05513 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKCZQ05513 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKCZQ05513 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKCZQ05513 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKCZQ05513 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKCZQ05513 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKCZQ05513 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKCZQ05513 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKCZQ05513 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKCZQ05513 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKCZQ05513 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKCZQ05513 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKCZQ05513 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKCZQ05513 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKCZQ05513 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKCZQ05513 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKCZQ05513 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKCZQ05513 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKCZQ05513 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKCZQ05513 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKCZQ05513 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKCZQ05513 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKCZQ05513 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKCZQ05513 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKCZQ05513 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKCZQ05513 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKCZQ05513 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKCZQ05513 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKCZQ05513 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKCZQ05513 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKCZQ05513 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKCZQ05513 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKCZQ05513 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKCZQ05513 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKCZQ05513 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKCZQ05513 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKCZQ05513 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKCZQ05513 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKCZQ05513 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKCZQ05513 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKCZQ05513 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKCZQ05513 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKCZQ05513 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKCZQ05513 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKCZQ05513 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKCZQ05513 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKCZQ05513 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKCZQ05513 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKCZQ05513 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKCZQ05513 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKCZQ05513 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKCZQ05513 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKCZQ05513 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 349.4 ms