Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GCNT1Q02742 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GCNT1Q02742 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GCNT1Q02742 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GCNT1Q02742 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GCNT1Q02742 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GCNT1Q02742 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GCNT1Q02742 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GCNT1Q02742 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GCNT1Q02742 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GCNT1Q02742 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GCNT1Q02742 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GCNT1Q02742 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GCNT1Q02742 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GCNT1Q02742 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GCNT1Q02742 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GCNT1Q02742 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GCNT1Q02742 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GCNT1Q02742 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GCNT1Q02742 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GCNT1Q02742 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GCNT1Q02742 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GCNT1Q02742 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GCNT1Q02742 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GCNT1Q02742 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms