Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1DQ01668 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1DQ01668 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1DQ01668 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1DQ01668 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1DQ01668 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1DQ01668 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1DQ01668 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1DQ01668 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1DQ01668 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1DQ01668 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1DQ01668 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1DQ01668 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1DQ01668 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1DQ01668 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1DQ01668 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1DQ01668 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1DQ01668 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1DQ01668 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1DQ01668 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1DQ01668 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1DQ01668 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1DQ01668 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1DQ01668 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1DQ01668 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1DQ01668 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1DQ01668 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1DQ01668 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1DQ01668 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1DQ01668 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1DQ01668 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1DQ01668 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1DQ01668 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1DQ01668 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1DQ01668 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1DQ01668 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1DQ01668 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1DQ01668 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1DQ01668 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1DQ01668 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1DQ01668 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1DQ01668 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1DQ01668 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1DQ01668 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1DQ01668 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1DQ01668 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1DQ01668 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1DQ01668 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1DQ01668 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1DQ01668 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1DQ01668 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1DQ01668 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1DQ01668 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1DQ01668 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1DQ01668 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1DQ01668 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1DQ01668 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1DQ01668 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1DQ01668 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1DQ01668 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1DQ01668 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1DQ01668 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1DQ01668 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1DQ01668 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1DQ01668 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1DQ01668 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1DQ01668 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1DQ01668 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CACNA1DQ01668 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CACNA1DQ01668 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CACNA1DQ01668 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms