Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MYBPC1Q00872 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MYBPC1Q00872 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MYBPC1Q00872 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MYBPC1Q00872 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MYBPC1Q00872 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MYBPC1Q00872 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MYBPC1Q00872 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MYBPC1Q00872 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MYBPC1Q00872 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MYBPC1Q00872 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MYBPC1Q00872 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MYBPC1Q00872 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MYBPC1Q00872 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MYBPC1Q00872 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MYBPC1Q00872 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MYBPC1Q00872 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MYBPC1Q00872 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MYBPC1Q00872 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MYBPC1Q00872 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MYBPC1Q00872 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MYBPC1Q00872 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MYBPC1Q00872 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MYBPC1Q00872 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MYBPC1Q00872 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MYBPC1Q00872 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MYBPC1Q00872 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MYBPC1Q00872 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MYBPC1Q00872 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MYBPC1Q00872 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MYBPC1Q00872 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MYBPC1Q00872 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MYBPC1Q00872 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MYBPC1Q00872 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MYBPC1Q00872 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MYBPC1Q00872 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MYBPC1Q00872 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MYBPC1Q00872 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MYBPC1Q00872 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MYBPC1Q00872 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MYBPC1Q00872 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MYBPC1Q00872 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MYBPC1Q00872 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MYBPC1Q00872 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MYBPC1Q00872 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MYBPC1Q00872 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
MYBPC1Q00872 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MYBPC1Q00872 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MYBPC1Q00872 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MYBPC1Q00872 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MYBPC1Q00872 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MYBPC1Q00872 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MYBPC1Q00872 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MYBPC1Q00872 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MYBPC1Q00872 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MYBPC1Q00872 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MYBPC1Q00872 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MYBPC1Q00872 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MYBPC1Q00872 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MYBPC1Q00872 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MYBPC1Q00872 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MYBPC1Q00872 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MYBPC1Q00872 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MYBPC1Q00872 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
MYBPC1Q00872 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MYBPC1Q00872 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MYBPC1Q00872 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MYBPC1Q00872 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MYBPC1Q00872 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MYBPC1Q00872 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MYBPC1Q00872 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MYBPC1Q00872 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
MYBPC1Q00872 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MYBPC1Q00872 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MYBPC1Q00872 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MYBPC1Q00872 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MYBPC1Q00872 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MYBPC1Q00872 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MYBPC1Q00872 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MYBPC1Q00872 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MYBPC1Q00872 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MYBPC1Q00872 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MYBPC1Q00872 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MYBPC1Q00872 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MYBPC1Q00872 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MYBPC1Q00872 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MYBPC1Q00872 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MYBPC1Q00872 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MYBPC1Q00872 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MYBPC1Q00872 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MYBPC1Q00872 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MYBPC1Q00872 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
MYBPC1Q00872 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MYBPC1Q00872 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MYBPC1Q00872 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MYBPC1Q00872 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MYBPC1Q00872 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MYBPC1Q00872 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MYBPC1Q00872 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
MYBPC1Q00872 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms