Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms