Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SMAD3P84022 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAD3P84022 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAD3P84022 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAD3P84022 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAD3P84022 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAD3P84022 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAD3P84022 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAD3P84022 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAD3P84022 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAD3P84022 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAD3P84022 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms