Protein–RNA interactions for Protein: P68036

UBE2L3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 L3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2L3P68036 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2L3P68036 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2L3P68036 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2L3P68036 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2L3P68036 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2L3P68036 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2L3P68036 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2L3P68036 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2L3P68036 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2L3P68036 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2L3P68036 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2L3P68036 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2L3P68036 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2L3P68036 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2L3P68036 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2L3P68036 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2L3P68036 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2L3P68036 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2L3P68036 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2L3P68036 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2L3P68036 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2L3P68036 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2L3P68036 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2L3P68036 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2L3P68036 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2L3P68036 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2L3P68036 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2L3P68036 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2L3P68036 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2L3P68036 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2L3P68036 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2L3P68036 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2L3P68036 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2L3P68036 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2L3P68036 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2L3P68036 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2L3P68036 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2L3P68036 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2L3P68036 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2L3P68036 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2L3P68036 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2L3P68036 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2L3P68036 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2L3P68036 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2L3P68036 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2L3P68036 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2L3P68036 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2L3P68036 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2L3P68036 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
UBE2L3P68036 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBE2L3P68036 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBE2L3P68036 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBE2L3P68036 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBE2L3P68036 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2L3P68036 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2L3P68036 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2L3P68036 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2L3P68036 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2L3P68036 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2L3P68036 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2L3P68036 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2L3P68036 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2L3P68036 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2L3P68036 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2L3P68036 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2L3P68036 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2L3P68036 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2L3P68036 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2L3P68036 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2L3P68036 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2L3P68036 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2L3P68036 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2L3P68036 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2L3P68036 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2L3P68036 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2L3P68036 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2L3P68036 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2L3P68036 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2L3P68036 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2L3P68036 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2L3P68036 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2L3P68036 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2L3P68036 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2L3P68036 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2L3P68036 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2L3P68036 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2L3P68036 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2L3P68036 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2L3P68036 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2L3P68036 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2L3P68036 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2L3P68036 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2L3P68036 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2L3P68036 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2L3P68036 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2L3P68036 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2L3P68036 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2L3P68036 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2L3P68036 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2L3P68036 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms