Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VBP1P61758 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VBP1P61758 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VBP1P61758 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
VBP1P61758 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VBP1P61758 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VBP1P61758 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VBP1P61758 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VBP1P61758 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VBP1P61758 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VBP1P61758 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VBP1P61758 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VBP1P61758 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VBP1P61758 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VBP1P61758 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VBP1P61758 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VBP1P61758 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VBP1P61758 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VBP1P61758 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VBP1P61758 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VBP1P61758 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VBP1P61758 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VBP1P61758 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VBP1P61758 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VBP1P61758 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VBP1P61758 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VBP1P61758 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VBP1P61758 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VBP1P61758 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VBP1P61758 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VBP1P61758 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VBP1P61758 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VBP1P61758 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VBP1P61758 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VBP1P61758 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VBP1P61758 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VBP1P61758 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VBP1P61758 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VBP1P61758 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VBP1P61758 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VBP1P61758 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VBP1P61758 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VBP1P61758 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VBP1P61758 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VBP1P61758 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VBP1P61758 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VBP1P61758 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
VBP1P61758 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VBP1P61758 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
VBP1P61758 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VBP1P61758 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VBP1P61758 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VBP1P61758 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VBP1P61758 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VBP1P61758 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VBP1P61758 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VBP1P61758 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VBP1P61758 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VBP1P61758 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VBP1P61758 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VBP1P61758 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VBP1P61758 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VBP1P61758 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VBP1P61758 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VBP1P61758 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VBP1P61758 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VBP1P61758 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
VBP1P61758 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
VBP1P61758 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VBP1P61758 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VBP1P61758 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VBP1P61758 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VBP1P61758 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VBP1P61758 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VBP1P61758 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VBP1P61758 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
VBP1P61758 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
VBP1P61758 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VBP1P61758 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VBP1P61758 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VBP1P61758 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VBP1P61758 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
VBP1P61758 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VBP1P61758 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VBP1P61758 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VBP1P61758 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VBP1P61758 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VBP1P61758 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VBP1P61758 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VBP1P61758 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VBP1P61758 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VBP1P61758 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VBP1P61758 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VBP1P61758 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VBP1P61758 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VBP1P61758 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VBP1P61758 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VBP1P61758 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VBP1P61758 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VBP1P61758 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms