Protein–RNA interactions for Protein: P61019

RAB2A, Ras-related protein Rab-2A, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB2AP61019 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB2AP61019 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB2AP61019 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB2AP61019 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB2AP61019 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB2AP61019 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB2AP61019 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB2AP61019 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB2AP61019 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB2AP61019 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB2AP61019 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB2AP61019 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB2AP61019 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB2AP61019 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB2AP61019 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB2AP61019 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB2AP61019 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB2AP61019 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB2AP61019 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB2AP61019 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB2AP61019 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB2AP61019 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB2AP61019 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB2AP61019 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB2AP61019 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB2AP61019 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB2AP61019 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB2AP61019 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB2AP61019 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB2AP61019 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB2AP61019 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB2AP61019 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB2AP61019 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB2AP61019 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB2AP61019 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB2AP61019 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB2AP61019 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB2AP61019 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB2AP61019 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB2AP61019 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB2AP61019 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB2AP61019 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB2AP61019 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB2AP61019 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB2AP61019 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB2AP61019 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB2AP61019 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB2AP61019 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB2AP61019 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB2AP61019 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB2AP61019 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB2AP61019 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB2AP61019 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB2AP61019 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB2AP61019 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB2AP61019 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB2AP61019 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB2AP61019 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB2AP61019 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB2AP61019 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB2AP61019 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB2AP61019 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB2AP61019 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB2AP61019 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB2AP61019 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB2AP61019 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB2AP61019 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB2AP61019 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB2AP61019 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB2AP61019 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB2AP61019 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB2AP61019 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB2AP61019 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB2AP61019 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB2AP61019 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB2AP61019 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB2AP61019 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB2AP61019 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB2AP61019 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB2AP61019 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB2AP61019 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB2AP61019 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB2AP61019 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB2AP61019 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB2AP61019 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB2AP61019 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB2AP61019 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB2AP61019 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB2AP61019 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB2AP61019 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB2AP61019 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB2AP61019 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB2AP61019 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB2AP61019 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
RAB2AP61019 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
RAB2AP61019 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RAB2AP61019 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms