Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTBP60709 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTBP60709 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTBP60709 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTBP60709 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTBP60709 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTBP60709 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTBP60709 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTBP60709 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTBP60709 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTBP60709 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTBP60709 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTBP60709 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTBP60709 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTBP60709 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTBP60709 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTBP60709 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTBP60709 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTBP60709 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTBP60709 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTBP60709 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTBP60709 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTBP60709 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTBP60709 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTBP60709 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTBP60709 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTBP60709 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTBP60709 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTBP60709 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTBP60709 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTBP60709 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTBP60709 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTBP60709 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTBP60709 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTBP60709 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTBP60709 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTBP60709 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTBP60709 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTBP60709 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTBP60709 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTBP60709 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTBP60709 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTBP60709 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTBP60709 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTBP60709 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTBP60709 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTBP60709 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTBP60709 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTBP60709 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTBP60709 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTBP60709 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTBP60709 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTBP60709 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTBP60709 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTBP60709 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTBP60709 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTBP60709 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTBP60709 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTBP60709 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTBP60709 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTBP60709 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTBP60709 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTBP60709 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTBP60709 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTBP60709 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTBP60709 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTBP60709 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTBP60709 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTBP60709 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTBP60709 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACTBP60709 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACTBP60709 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACTBP60709 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACTBP60709 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACTBP60709 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACTBP60709 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACTBP60709 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACTBP60709 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ACTBP60709 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACTBP60709 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACTBP60709 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACTBP60709 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACTBP60709 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACTBP60709 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACTBP60709 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ACTBP60709 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ACTBP60709 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ACTBP60709 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ACTBP60709 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ACTBP60709 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ACTBP60709 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTBP60709 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTBP60709 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTBP60709 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTBP60709 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTBP60709 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTBP60709 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTBP60709 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTBP60709 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTBP60709 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms