Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJA9P57773 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GJA9P57773 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJA9P57773 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJA9P57773 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJA9P57773 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJA9P57773 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJA9P57773 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJA9P57773 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJA9P57773 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJA9P57773 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJA9P57773 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJA9P57773 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJA9P57773 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA9P57773 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA9P57773 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA9P57773 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA9P57773 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA9P57773 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA9P57773 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA9P57773 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA9P57773 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA9P57773 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA9P57773 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA9P57773 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA9P57773 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA9P57773 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA9P57773 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA9P57773 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA9P57773 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA9P57773 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA9P57773 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA9P57773 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA9P57773 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA9P57773 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA9P57773 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA9P57773 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA9P57773 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA9P57773 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA9P57773 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA9P57773 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA9P57773 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA9P57773 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA9P57773 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA9P57773 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA9P57773 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA9P57773 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA9P57773 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA9P57773 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA9P57773 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA9P57773 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA9P57773 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA9P57773 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA9P57773 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA9P57773 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA9P57773 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GJA9P57773 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GJA9P57773 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GJA9P57773 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GJA9P57773 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GJA9P57773 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GJA9P57773 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GJA9P57773 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJA9P57773 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GJA9P57773 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJA9P57773 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJA9P57773 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJA9P57773 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GJA9P57773 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJA9P57773 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GJA9P57773 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJA9P57773 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJA9P57773 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJA9P57773 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJA9P57773 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJA9P57773 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJA9P57773 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJA9P57773 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJA9P57773 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJA9P57773 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJA9P57773 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJA9P57773 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJA9P57773 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJA9P57773 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJA9P57773 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJA9P57773 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJA9P57773 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GJA9P57773 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GJA9P57773 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJA9P57773 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJA9P57773 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJA9P57773 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJA9P57773 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJA9P57773 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJA9P57773 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJA9P57773 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJA9P57773 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJA9P57773 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJA9P57773 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJA9P57773 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms