Protein–RNA interactions for Protein: P56180

TPTE, Putative tyrosine-protein phosphatase TPTE, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTEP56180 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TPTEP56180 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TPTEP56180 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TPTEP56180 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TPTEP56180 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TPTEP56180 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TPTEP56180 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TPTEP56180 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TPTEP56180 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TPTEP56180 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TPTEP56180 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPTEP56180 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPTEP56180 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPTEP56180 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPTEP56180 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPTEP56180 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPTEP56180 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPTEP56180 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPTEP56180 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPTEP56180 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPTEP56180 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPTEP56180 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TPTEP56180 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPTEP56180 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPTEP56180 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPTEP56180 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPTEP56180 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPTEP56180 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPTEP56180 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPTEP56180 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPTEP56180 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPTEP56180 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPTEP56180 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPTEP56180 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPTEP56180 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPTEP56180 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPTEP56180 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPTEP56180 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TPTEP56180 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPTEP56180 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPTEP56180 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPTEP56180 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPTEP56180 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPTEP56180 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPTEP56180 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TPTEP56180 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPTEP56180 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPTEP56180 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPTEP56180 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPTEP56180 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPTEP56180 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPTEP56180 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPTEP56180 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPTEP56180 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPTEP56180 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPTEP56180 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPTEP56180 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPTEP56180 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPTEP56180 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TPTEP56180 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPTEP56180 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TPTEP56180 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TPTEP56180 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TPTEP56180 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TPTEP56180 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TPTEP56180 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TPTEP56180 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TPTEP56180 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TPTEP56180 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPTEP56180 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPTEP56180 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPTEP56180 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPTEP56180 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPTEP56180 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPTEP56180 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPTEP56180 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPTEP56180 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TPTEP56180 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPTEP56180 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPTEP56180 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPTEP56180 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPTEP56180 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPTEP56180 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPTEP56180 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPTEP56180 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPTEP56180 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPTEP56180 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
TPTEP56180 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPTEP56180 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TPTEP56180 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPTEP56180 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPTEP56180 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TPTEP56180 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TPTEP56180 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPTEP56180 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPTEP56180 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPTEP56180 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
TPTEP56180 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
TPTEP56180 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPTEP56180 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms