Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELLP55199 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELLP55199 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELLP55199 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELLP55199 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELLP55199 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELLP55199 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELLP55199 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELLP55199 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELLP55199 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELLP55199 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELLP55199 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELLP55199 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELLP55199 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELLP55199 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELLP55199 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELLP55199 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELLP55199 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELLP55199 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELLP55199 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELLP55199 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELLP55199 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELLP55199 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELLP55199 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELLP55199 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELLP55199 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELLP55199 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELLP55199 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELLP55199 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELLP55199 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELLP55199 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELLP55199 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELLP55199 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELLP55199 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELLP55199 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELLP55199 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELLP55199 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELLP55199 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELLP55199 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELLP55199 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELLP55199 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELLP55199 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELLP55199 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELLP55199 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELLP55199 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELLP55199 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELLP55199 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELLP55199 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELLP55199 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELLP55199 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELLP55199 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELLP55199 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELLP55199 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELLP55199 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELLP55199 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELLP55199 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELLP55199 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELLP55199 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELLP55199 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELLP55199 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELLP55199 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELLP55199 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ELLP55199 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELLP55199 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELLP55199 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELLP55199 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELLP55199 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELLP55199 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELLP55199 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELLP55199 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELLP55199 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELLP55199 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELLP55199 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELLP55199 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELLP55199 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELLP55199 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELLP55199 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELLP55199 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELLP55199 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELLP55199 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELLP55199 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELLP55199 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELLP55199 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELLP55199 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELLP55199 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELLP55199 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELLP55199 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELLP55199 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELLP55199 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELLP55199 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELLP55199 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ELLP55199 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ELLP55199 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELLP55199 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELLP55199 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELLP55199 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELLP55199 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELLP55199 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELLP55199 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELLP55199 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms