Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HIRAP54198 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HIRAP54198 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HIRAP54198 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HIRAP54198 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HIRAP54198 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HIRAP54198 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HIRAP54198 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HIRAP54198 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HIRAP54198 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HIRAP54198 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HIRAP54198 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HIRAP54198 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HIRAP54198 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HIRAP54198 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HIRAP54198 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HIRAP54198 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HIRAP54198 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HIRAP54198 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HIRAP54198 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HIRAP54198 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HIRAP54198 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HIRAP54198 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HIRAP54198 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HIRAP54198 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HIRAP54198 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HIRAP54198 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HIRAP54198 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HIRAP54198 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HIRAP54198 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HIRAP54198 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIRAP54198 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIRAP54198 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIRAP54198 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIRAP54198 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIRAP54198 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIRAP54198 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIRAP54198 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
HIRAP54198 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIRAP54198 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIRAP54198 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIRAP54198 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIRAP54198 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIRAP54198 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIRAP54198 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIRAP54198 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIRAP54198 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIRAP54198 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIRAP54198 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIRAP54198 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIRAP54198 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIRAP54198 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIRAP54198 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIRAP54198 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIRAP54198 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIRAP54198 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIRAP54198 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIRAP54198 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIRAP54198 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIRAP54198 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HIRAP54198 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIRAP54198 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIRAP54198 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIRAP54198 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HIRAP54198 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HIRAP54198 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HIRAP54198 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HIRAP54198 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HIRAP54198 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HIRAP54198 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HIRAP54198 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HIRAP54198 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HIRAP54198 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HIRAP54198 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HIRAP54198 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HIRAP54198 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HIRAP54198 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HIRAP54198 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HIRAP54198 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HIRAP54198 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HIRAP54198 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HIRAP54198 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HIRAP54198 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HIRAP54198 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HIRAP54198 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HIRAP54198 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
HIRAP54198 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HIRAP54198 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HIRAP54198 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HIRAP54198 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HIRAP54198 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HIRAP54198 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HIRAP54198 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HIRAP54198 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HIRAP54198 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HIRAP54198 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HIRAP54198 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HIRAP54198 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HIRAP54198 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HIRAP54198 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms