Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
SMARCA4P51532 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
SMARCA4P51532 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
SMARCA4P51532 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
SMARCA4P51532 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
SMARCA4P51532 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
SMARCA4P51532 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
SMARCA4P51532 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
SMARCA4P51532 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
SMARCA4P51532 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
SMARCA4P51532 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
SMARCA4P51532 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
SMARCA4P51532 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
SMARCA4P51532 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
SMARCA4P51532 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
SMARCA4P51532 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
SMARCA4P51532 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
SMARCA4P51532 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
SMARCA4P51532 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC35.86■■■■□ 3.33
SMARCA4P51532 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
SMARCA4P51532 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
SMARCA4P51532 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
SMARCA4P51532 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
SMARCA4P51532 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
SMARCA4P51532 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
SMARCA4P51532 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
SMARCA4P51532 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
SMARCA4P51532 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
SMARCA4P51532 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
SMARCA4P51532 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
SMARCA4P51532 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
SMARCA4P51532 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
SMARCA4P51532 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
SMARCA4P51532 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
SMARCA4P51532 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
SMARCA4P51532 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
SMARCA4P51532 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
SMARCA4P51532 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
SMARCA4P51532 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
SMARCA4P51532 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
SMARCA4P51532 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC35.85■■■■□ 3.33
SMARCA4P51532 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
SMARCA4P51532 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
SMARCA4P51532 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
SMARCA4P51532 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
SMARCA4P51532 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
SMARCA4P51532 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
SMARCA4P51532 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
SMARCA4P51532 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
SMARCA4P51532 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
SMARCA4P51532 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
SMARCA4P51532 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
SMARCA4P51532 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
SMARCA4P51532 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC35.84■■■■□ 3.33
SMARCA4P51532 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
SMARCA4P51532 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC35.84■■■■□ 3.33
SMARCA4P51532 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
SMARCA4P51532 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
SMARCA4P51532 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
SMARCA4P51532 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
SMARCA4P51532 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
SMARCA4P51532 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
SMARCA4P51532 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
SMARCA4P51532 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
SMARCA4P51532 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
SMARCA4P51532 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
SMARCA4P51532 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
SMARCA4P51532 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
SMARCA4P51532 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
SMARCA4P51532 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
SMARCA4P51532 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
SMARCA4P51532 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
SMARCA4P51532 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
SMARCA4P51532 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
SMARCA4P51532 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
SMARCA4P51532 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
SMARCA4P51532 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
SMARCA4P51532 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC35.82■■■■□ 3.32
SMARCA4P51532 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
SMARCA4P51532 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
SMARCA4P51532 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
SMARCA4P51532 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
SMARCA4P51532 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
SMARCA4P51532 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
SMARCA4P51532 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
SMARCA4P51532 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
SMARCA4P51532 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
SMARCA4P51532 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
SMARCA4P51532 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
SMARCA4P51532 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
SMARCA4P51532 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
SMARCA4P51532 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
SMARCA4P51532 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
SMARCA4P51532 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
SMARCA4P51532 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
SMARCA4P51532 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
SMARCA4P51532 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
SMARCA4P51532 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
SMARCA4P51532 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
SMARCA4P51532 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms