Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MRE11P49959 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MRE11P49959 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MRE11P49959 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MRE11P49959 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MRE11P49959 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MRE11P49959 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MRE11P49959 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MRE11P49959 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MRE11P49959 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MRE11P49959 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MRE11P49959 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MRE11P49959 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MRE11P49959 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MRE11P49959 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MRE11P49959 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MRE11P49959 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MRE11P49959 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MRE11P49959 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MRE11P49959 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MRE11P49959 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MRE11P49959 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MRE11P49959 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MRE11P49959 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MRE11P49959 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MRE11P49959 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MRE11P49959 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MRE11P49959 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MRE11P49959 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MRE11P49959 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MRE11P49959 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MRE11P49959 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MRE11P49959 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MRE11P49959 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MRE11P49959 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MRE11P49959 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MRE11P49959 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MRE11P49959 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MRE11P49959 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MRE11P49959 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MRE11P49959 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MRE11P49959 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MRE11P49959 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MRE11P49959 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MRE11P49959 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MRE11P49959 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MRE11P49959 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MRE11P49959 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MRE11P49959 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MRE11P49959 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MRE11P49959 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MRE11P49959 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MRE11P49959 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MRE11P49959 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MRE11P49959 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MRE11P49959 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MRE11P49959 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MRE11P49959 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MRE11P49959 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MRE11P49959 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MRE11P49959 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MRE11P49959 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MRE11P49959 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MRE11P49959 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MRE11P49959 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MRE11P49959 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MRE11P49959 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MRE11P49959 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MRE11P49959 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MRE11P49959 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MRE11P49959 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MRE11P49959 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MRE11P49959 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MRE11P49959 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MRE11P49959 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MRE11P49959 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MRE11P49959 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MRE11P49959 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRE11P49959 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRE11P49959 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRE11P49959 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRE11P49959 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRE11P49959 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRE11P49959 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRE11P49959 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRE11P49959 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRE11P49959 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRE11P49959 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRE11P49959 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MRE11P49959 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRE11P49959 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRE11P49959 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRE11P49959 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRE11P49959 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRE11P49959 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRE11P49959 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRE11P49959 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRE11P49959 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRE11P49959 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRE11P49959 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms