Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
NUP153P49790 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
NUP153P49790 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NUP153P49790 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
NUP153P49790 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
NUP153P49790 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
NUP153P49790 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
NUP153P49790 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
NUP153P49790 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
NUP153P49790 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
NUP153P49790 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
NUP153P49790 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
NUP153P49790 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
NUP153P49790 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
NUP153P49790 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC31.07■■■□□ 2.56
NUP153P49790 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
NUP153P49790 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NUP153P49790 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NUP153P49790 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NUP153P49790 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NUP153P49790 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NUP153P49790 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NUP153P49790 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
NUP153P49790 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
NUP153P49790 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
NUP153P49790 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
NUP153P49790 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NUP153P49790 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
NUP153P49790 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NUP153P49790 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
NUP153P49790 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NUP153P49790 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NUP153P49790 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NUP153P49790 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
NUP153P49790 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NUP153P49790 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NUP153P49790 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NUP153P49790 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
NUP153P49790 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
NUP153P49790 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
NUP153P49790 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
NUP153P49790 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NUP153P49790 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
NUP153P49790 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NUP153P49790 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NUP153P49790 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NUP153P49790 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
NUP153P49790 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NUP153P49790 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NUP153P49790 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NUP153P49790 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NUP153P49790 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NUP153P49790 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
NUP153P49790 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NUP153P49790 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NUP153P49790 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NUP153P49790 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
NUP153P49790 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NUP153P49790 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
NUP153P49790 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NUP153P49790 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
NUP153P49790 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NUP153P49790 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
NUP153P49790 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NUP153P49790 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NUP153P49790 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
NUP153P49790 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
NUP153P49790 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NUP153P49790 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
NUP153P49790 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NUP153P49790 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
NUP153P49790 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NUP153P49790 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
NUP153P49790 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
NUP153P49790 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NUP153P49790 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NUP153P49790 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
NUP153P49790 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NUP153P49790 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NUP153P49790 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
NUP153P49790 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
NUP153P49790 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
NUP153P49790 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.56
NUP153P49790 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
NUP153P49790 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
NUP153P49790 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
NUP153P49790 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
NUP153P49790 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
NUP153P49790 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
NUP153P49790 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.55
NUP153P49790 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
NUP153P49790 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
NUP153P49790 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.01■■■□□ 2.55
NUP153P49790 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
NUP153P49790 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NUP153P49790 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NUP153P49790 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
NUP153P49790 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
NUP153P49790 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
NUP153P49790 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms