Protein–RNA interactions for Protein: P49447

CYB561, Cytochrome b561, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYB561P49447 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYB561P49447 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYB561P49447 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYB561P49447 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYB561P49447 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYB561P49447 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYB561P49447 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYB561P49447 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYB561P49447 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYB561P49447 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYB561P49447 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYB561P49447 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYB561P49447 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYB561P49447 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYB561P49447 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYB561P49447 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CYB561P49447 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CYB561P49447 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYB561P49447 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYB561P49447 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYB561P49447 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYB561P49447 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYB561P49447 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYB561P49447 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYB561P49447 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYB561P49447 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYB561P49447 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYB561P49447 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYB561P49447 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYB561P49447 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CYB561P49447 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYB561P49447 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYB561P49447 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYB561P49447 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYB561P49447 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYB561P49447 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYB561P49447 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYB561P49447 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYB561P49447 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYB561P49447 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYB561P49447 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYB561P49447 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYB561P49447 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYB561P49447 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYB561P49447 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYB561P49447 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYB561P49447 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYB561P49447 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYB561P49447 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYB561P49447 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYB561P49447 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CYB561P49447 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYB561P49447 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYB561P49447 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYB561P49447 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYB561P49447 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYB561P49447 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CYB561P49447 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CYB561P49447 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYB561P49447 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYB561P49447 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYB561P49447 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYB561P49447 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYB561P49447 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYB561P49447 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYB561P49447 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYB561P49447 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYB561P49447 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYB561P49447 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYB561P49447 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYB561P49447 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYB561P49447 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYB561P49447 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYB561P49447 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYB561P49447 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYB561P49447 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYB561P49447 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYB561P49447 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CYB561P49447 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYB561P49447 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CYB561P49447 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYB561P49447 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYB561P49447 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYB561P49447 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYB561P49447 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYB561P49447 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYB561P49447 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYB561P49447 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYB561P49447 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CYB561P49447 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYB561P49447 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYB561P49447 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYB561P49447 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYB561P49447 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYB561P49447 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYB561P49447 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYB561P49447 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYB561P49447 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYB561P49447 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYB561P49447 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms