Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms