Protein–RNA interactions for Protein: P46781

RPS9, 40S ribosomal protein S9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS9P46781 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS9P46781 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS9P46781 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS9P46781 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS9P46781 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS9P46781 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS9P46781 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS9P46781 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS9P46781 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS9P46781 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS9P46781 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS9P46781 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS9P46781 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS9P46781 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS9P46781 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS9P46781 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS9P46781 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS9P46781 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS9P46781 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS9P46781 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS9P46781 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS9P46781 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS9P46781 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS9P46781 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS9P46781 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS9P46781 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS9P46781 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS9P46781 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS9P46781 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS9P46781 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS9P46781 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS9P46781 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS9P46781 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS9P46781 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS9P46781 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS9P46781 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS9P46781 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS9P46781 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS9P46781 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS9P46781 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS9P46781 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS9P46781 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS9P46781 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS9P46781 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS9P46781 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS9P46781 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS9P46781 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS9P46781 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS9P46781 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS9P46781 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS9P46781 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS9P46781 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS9P46781 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS9P46781 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS9P46781 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS9P46781 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS9P46781 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS9P46781 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS9P46781 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS9P46781 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS9P46781 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS9P46781 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS9P46781 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS9P46781 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS9P46781 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS9P46781 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS9P46781 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS9P46781 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS9P46781 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS9P46781 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS9P46781 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS9P46781 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS9P46781 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS9P46781 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS9P46781 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPS9P46781 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPS9P46781 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPS9P46781 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPS9P46781 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPS9P46781 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPS9P46781 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPS9P46781 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPS9P46781 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPS9P46781 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPS9P46781 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPS9P46781 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPS9P46781 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPS9P46781 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPS9P46781 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RPS9P46781 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RPS9P46781 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RPS9P46781 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RPS9P46781 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RPS9P46781 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RPS9P46781 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPS9P46781 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPS9P46781 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPS9P46781 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPS9P46781 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPS9P46781 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms