Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms