Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms