Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms