Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD12P35452 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD12P35452 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD12P35452 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD12P35452 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD12P35452 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD12P35452 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD12P35452 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD12P35452 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD12P35452 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD12P35452 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD12P35452 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD12P35452 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD12P35452 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD12P35452 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD12P35452 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD12P35452 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD12P35452 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD12P35452 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD12P35452 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD12P35452 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD12P35452 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD12P35452 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD12P35452 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD12P35452 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD12P35452 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD12P35452 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD12P35452 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD12P35452 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD12P35452 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD12P35452 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD12P35452 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD12P35452 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD12P35452 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD12P35452 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD12P35452 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD12P35452 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD12P35452 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD12P35452 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD12P35452 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD12P35452 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD12P35452 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD12P35452 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD12P35452 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD12P35452 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD12P35452 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD12P35452 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD12P35452 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD12P35452 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD12P35452 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD12P35452 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD12P35452 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD12P35452 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD12P35452 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD12P35452 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD12P35452 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD12P35452 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD12P35452 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD12P35452 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD12P35452 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXD12P35452 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXD12P35452 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXD12P35452 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXD12P35452 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXD12P35452 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXD12P35452 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXD12P35452 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXD12P35452 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXD12P35452 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXD12P35452 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXD12P35452 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXD12P35452 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXD12P35452 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXD12P35452 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXD12P35452 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXD12P35452 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXD12P35452 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXD12P35452 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms