Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASQ1P31415 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASQ1P31415 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASQ1P31415 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASQ1P31415 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASQ1P31415 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CASQ1P31415 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASQ1P31415 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CASQ1P31415 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CASQ1P31415 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASQ1P31415 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASQ1P31415 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CASQ1P31415 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CASQ1P31415 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CASQ1P31415 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CASQ1P31415 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CASQ1P31415 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASQ1P31415 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CASQ1P31415 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASQ1P31415 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CASQ1P31415 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASQ1P31415 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CASQ1P31415 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASQ1P31415 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASQ1P31415 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASQ1P31415 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASQ1P31415 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CASQ1P31415 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASQ1P31415 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASQ1P31415 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASQ1P31415 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CASQ1P31415 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CASQ1P31415 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASQ1P31415 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASQ1P31415 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CASQ1P31415 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASQ1P31415 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CASQ1P31415 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CASQ1P31415 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CASQ1P31415 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASQ1P31415 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASQ1P31415 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASQ1P31415 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CASQ1P31415 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CASQ1P31415 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASQ1P31415 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CASQ1P31415 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASQ1P31415 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CASQ1P31415 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CASQ1P31415 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASQ1P31415 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CASQ1P31415 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASQ1P31415 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASQ1P31415 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASQ1P31415 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CASQ1P31415 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASQ1P31415 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CASQ1P31415 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASQ1P31415 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CASQ1P31415 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASQ1P31415 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CASQ1P31415 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASQ1P31415 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASQ1P31415 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CASQ1P31415 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CASQ1P31415 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASQ1P31415 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CASQ1P31415 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASQ1P31415 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CASQ1P31415 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASQ1P31415 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASQ1P31415 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CASQ1P31415 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASQ1P31415 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASQ1P31415 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CASQ1P31415 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CASQ1P31415 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASQ1P31415 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CASQ1P31415 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CASQ1P31415 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CASQ1P31415 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASQ1P31415 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CASQ1P31415 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CASQ1P31415 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASQ1P31415 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASQ1P31415 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CASQ1P31415 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CASQ1P31415 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASQ1P31415 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASQ1P31415 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASQ1P31415 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASQ1P31415 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CASQ1P31415 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CASQ1P31415 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CASQ1P31415 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CASQ1P31415 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASQ1P31415 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CASQ1P31415 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CASQ1P31415 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CASQ1P31415 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
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