Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms