Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD34P28906 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD34P28906 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD34P28906 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD34P28906 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD34P28906 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD34P28906 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD34P28906 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD34P28906 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD34P28906 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD34P28906 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD34P28906 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD34P28906 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD34P28906 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD34P28906 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD34P28906 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD34P28906 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD34P28906 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD34P28906 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD34P28906 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD34P28906 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD34P28906 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD34P28906 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CD34P28906 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CD34P28906 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CD34P28906 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CD34P28906 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CD34P28906 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CD34P28906 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CD34P28906 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CD34P28906 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CD34P28906 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CD34P28906 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CD34P28906 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CD34P28906 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CD34P28906 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CD34P28906 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CD34P28906 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CD34P28906 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CD34P28906 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CD34P28906 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CD34P28906 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CD34P28906 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CD34P28906 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CD34P28906 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CD34P28906 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CD34P28906 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CD34P28906 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CD34P28906 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CD34P28906 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CD34P28906 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CD34P28906 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CD34P28906 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CD34P28906 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CD34P28906 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CD34P28906 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CD34P28906 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CD34P28906 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CD34P28906 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CD34P28906 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CD34P28906 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CD34P28906 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CD34P28906 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CD34P28906 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CD34P28906 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CD34P28906 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CD34P28906 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CD34P28906 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CD34P28906 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CD34P28906 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CD34P28906 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CD34P28906 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD34P28906 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CD34P28906 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD34P28906 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD34P28906 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD34P28906 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD34P28906 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD34P28906 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD34P28906 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD34P28906 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD34P28906 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD34P28906 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD34P28906 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD34P28906 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CD34P28906 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD34P28906 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD34P28906 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD34P28906 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CD34P28906 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD34P28906 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD34P28906 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD34P28906 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD34P28906 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD34P28906 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD34P28906 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD34P28906 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD34P28906 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD34P28906 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD34P28906 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms