Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PLNP26678 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PLNP26678 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PLNP26678 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PLNP26678 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PLNP26678 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PLNP26678 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PLNP26678 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PLNP26678 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PLNP26678 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PLNP26678 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PLNP26678 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PLNP26678 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PLNP26678 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PLNP26678 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PLNP26678 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PLNP26678 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PLNP26678 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PLNP26678 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PLNP26678 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PLNP26678 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PLNP26678 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
PLNP26678 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PLNP26678 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PLNP26678 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PLNP26678 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PLNP26678 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PLNP26678 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PLNP26678 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PLNP26678 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
PLNP26678 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PLNP26678 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PLNP26678 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PLNP26678 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PLNP26678 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PLNP26678 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PLNP26678 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PLNP26678 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PLNP26678 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PLNP26678 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PLNP26678 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PLNP26678 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PLNP26678 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PLNP26678 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PLNP26678 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PLNP26678 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PLNP26678 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PLNP26678 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PLNP26678 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PLNP26678 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
PLNP26678 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PLNP26678 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PLNP26678 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PLNP26678 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PLNP26678 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PLNP26678 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PLNP26678 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PLNP26678 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PLNP26678 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PLNP26678 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PLNP26678 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PLNP26678 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PLNP26678 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PLNP26678 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PLNP26678 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PLNP26678 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PLNP26678 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PLNP26678 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PLNP26678 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PLNP26678 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PLNP26678 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PLNP26678 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PLNP26678 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PLNP26678 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
PLNP26678 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PLNP26678 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PLNP26678 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PLNP26678 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PLNP26678 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PLNP26678 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PLNP26678 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PLNP26678 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PLNP26678 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PLNP26678 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PLNP26678 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PLNP26678 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PLNP26678 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PLNP26678 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
PLNP26678 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PLNP26678 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PLNP26678 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PLNP26678 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PLNP26678 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PLNP26678 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PLNP26678 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PLNP26678 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PLNP26678 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PLNP26678 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PLNP26678 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PLNP26678 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms