Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EGR1P18146 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EGR1P18146 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EGR1P18146 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
EGR1P18146 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EGR1P18146 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EGR1P18146 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EGR1P18146 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EGR1P18146 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EGR1P18146 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EGR1P18146 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EGR1P18146 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EGR1P18146 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
EGR1P18146 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EGR1P18146 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EGR1P18146 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EGR1P18146 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EGR1P18146 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EGR1P18146 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EGR1P18146 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EGR1P18146 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EGR1P18146 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EGR1P18146 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EGR1P18146 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EGR1P18146 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
EGR1P18146 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EGR1P18146 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EGR1P18146 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EGR1P18146 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EGR1P18146 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EGR1P18146 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EGR1P18146 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EGR1P18146 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EGR1P18146 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EGR1P18146 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EGR1P18146 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EGR1P18146 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EGR1P18146 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EGR1P18146 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EGR1P18146 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EGR1P18146 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EGR1P18146 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EGR1P18146 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
EGR1P18146 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EGR1P18146 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
EGR1P18146 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EGR1P18146 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EGR1P18146 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
EGR1P18146 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EGR1P18146 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EGR1P18146 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EGR1P18146 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
EGR1P18146 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EGR1P18146 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
EGR1P18146 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
EGR1P18146 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
EGR1P18146 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EGR1P18146 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EGR1P18146 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EGR1P18146 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EGR1P18146 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EGR1P18146 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EGR1P18146 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EGR1P18146 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EGR1P18146 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EGR1P18146 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EGR1P18146 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EGR1P18146 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EGR1P18146 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EGR1P18146 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EGR1P18146 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EGR1P18146 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EGR1P18146 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EGR1P18146 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
EGR1P18146 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EGR1P18146 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EGR1P18146 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EGR1P18146 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EGR1P18146 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
EGR1P18146 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
EGR1P18146 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EGR1P18146 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EGR1P18146 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR1P18146 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR1P18146 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR1P18146 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR1P18146 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR1P18146 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR1P18146 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR1P18146 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR1P18146 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR1P18146 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR1P18146 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR1P18146 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR1P18146 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR1P18146 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR1P18146 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR1P18146 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR1P18146 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR1P18146 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms