Protein–RNA interactions for Protein: P18085

ARF4, ADP-ribosylation factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF4P18085 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARF4P18085 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARF4P18085 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ARF4P18085 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ARF4P18085 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARF4P18085 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARF4P18085 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARF4P18085 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ARF4P18085 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ARF4P18085 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ARF4P18085 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ARF4P18085 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ARF4P18085 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ARF4P18085 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARF4P18085 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARF4P18085 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARF4P18085 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARF4P18085 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARF4P18085 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARF4P18085 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARF4P18085 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARF4P18085 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARF4P18085 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ARF4P18085 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ARF4P18085 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARF4P18085 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARF4P18085 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARF4P18085 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARF4P18085 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARF4P18085 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ARF4P18085 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARF4P18085 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARF4P18085 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARF4P18085 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARF4P18085 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ARF4P18085 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARF4P18085 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ARF4P18085 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARF4P18085 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARF4P18085 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARF4P18085 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARF4P18085 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARF4P18085 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARF4P18085 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARF4P18085 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARF4P18085 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ARF4P18085 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARF4P18085 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARF4P18085 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARF4P18085 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ARF4P18085 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARF4P18085 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARF4P18085 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARF4P18085 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARF4P18085 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARF4P18085 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARF4P18085 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARF4P18085 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARF4P18085 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARF4P18085 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARF4P18085 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARF4P18085 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ARF4P18085 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ARF4P18085 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARF4P18085 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARF4P18085 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARF4P18085 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARF4P18085 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARF4P18085 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARF4P18085 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARF4P18085 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARF4P18085 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARF4P18085 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARF4P18085 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARF4P18085 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARF4P18085 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARF4P18085 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARF4P18085 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARF4P18085 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARF4P18085 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARF4P18085 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARF4P18085 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARF4P18085 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARF4P18085 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARF4P18085 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARF4P18085 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARF4P18085 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARF4P18085 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARF4P18085 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ARF4P18085 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARF4P18085 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARF4P18085 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARF4P18085 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARF4P18085 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARF4P18085 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARF4P18085 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARF4P18085 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARF4P18085 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARF4P18085 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARF4P18085 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms