Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VEGFAP15692 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VEGFAP15692 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VEGFAP15692 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VEGFAP15692 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VEGFAP15692 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
VEGFAP15692 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VEGFAP15692 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VEGFAP15692 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VEGFAP15692 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VEGFAP15692 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VEGFAP15692 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VEGFAP15692 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VEGFAP15692 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VEGFAP15692 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VEGFAP15692 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
VEGFAP15692 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VEGFAP15692 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VEGFAP15692 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VEGFAP15692 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VEGFAP15692 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VEGFAP15692 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VEGFAP15692 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
VEGFAP15692 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VEGFAP15692 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VEGFAP15692 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VEGFAP15692 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VEGFAP15692 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms