Protein–RNA interactions for Protein: P09238

MMP10, Stromelysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP10P09238 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MMP10P09238 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MMP10P09238 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MMP10P09238 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MMP10P09238 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MMP10P09238 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MMP10P09238 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MMP10P09238 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MMP10P09238 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MMP10P09238 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MMP10P09238 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MMP10P09238 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MMP10P09238 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MMP10P09238 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MMP10P09238 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
MMP10P09238 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MMP10P09238 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MMP10P09238 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MMP10P09238 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MMP10P09238 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MMP10P09238 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MMP10P09238 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MMP10P09238 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MMP10P09238 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MMP10P09238 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MMP10P09238 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MMP10P09238 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MMP10P09238 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MMP10P09238 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MMP10P09238 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MMP10P09238 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MMP10P09238 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MMP10P09238 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MMP10P09238 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MMP10P09238 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MMP10P09238 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MMP10P09238 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
MMP10P09238 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
MMP10P09238 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MMP10P09238 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MMP10P09238 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
MMP10P09238 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MMP10P09238 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MMP10P09238 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MMP10P09238 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MMP10P09238 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MMP10P09238 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MMP10P09238 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
MMP10P09238 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MMP10P09238 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MMP10P09238 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MMP10P09238 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MMP10P09238 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MMP10P09238 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MMP10P09238 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MMP10P09238 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MMP10P09238 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MMP10P09238 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MMP10P09238 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MMP10P09238 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MMP10P09238 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MMP10P09238 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MMP10P09238 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MMP10P09238 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MMP10P09238 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MMP10P09238 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MMP10P09238 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MMP10P09238 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MMP10P09238 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MMP10P09238 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MMP10P09238 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MMP10P09238 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MMP10P09238 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MMP10P09238 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MMP10P09238 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MMP10P09238 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MMP10P09238 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
MMP10P09238 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MMP10P09238 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MMP10P09238 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MMP10P09238 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MMP10P09238 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MMP10P09238 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MMP10P09238 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MMP10P09238 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MMP10P09238 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MMP10P09238 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
MMP10P09238 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MMP10P09238 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.56
MMP10P09238 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MMP10P09238 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MMP10P09238 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MMP10P09238 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MMP10P09238 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MMP10P09238 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MMP10P09238 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MMP10P09238 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MMP10P09238 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
MMP10P09238 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
MMP10P09238 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms