Protein–RNA interactions for Protein: P01568

IFNA21, Interferon alpha-21, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA21P01568 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNA21P01568 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNA21P01568 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNA21P01568 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNA21P01568 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNA21P01568 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNA21P01568 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNA21P01568 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNA21P01568 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNA21P01568 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNA21P01568 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNA21P01568 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNA21P01568 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNA21P01568 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNA21P01568 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNA21P01568 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNA21P01568 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNA21P01568 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNA21P01568 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNA21P01568 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNA21P01568 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNA21P01568 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNA21P01568 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNA21P01568 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNA21P01568 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNA21P01568 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNA21P01568 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNA21P01568 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNA21P01568 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNA21P01568 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNA21P01568 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNA21P01568 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNA21P01568 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNA21P01568 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNA21P01568 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNA21P01568 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNA21P01568 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNA21P01568 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNA21P01568 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
IFNA21P01568 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IFNA21P01568 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IFNA21P01568 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
IFNA21P01568 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IFNA21P01568 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
IFNA21P01568 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IFNA21P01568 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA21P01568 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA21P01568 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA21P01568 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA21P01568 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA21P01568 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA21P01568 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA21P01568 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA21P01568 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA21P01568 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA21P01568 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA21P01568 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA21P01568 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA21P01568 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA21P01568 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA21P01568 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA21P01568 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA21P01568 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA21P01568 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA21P01568 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA21P01568 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA21P01568 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA21P01568 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA21P01568 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA21P01568 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA21P01568 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA21P01568 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA21P01568 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA21P01568 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA21P01568 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA21P01568 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA21P01568 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA21P01568 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA21P01568 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA21P01568 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA21P01568 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA21P01568 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA21P01568 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA21P01568 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA21P01568 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA21P01568 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA21P01568 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA21P01568 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA21P01568 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA21P01568 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA21P01568 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA21P01568 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA21P01568 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA21P01568 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA21P01568 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA21P01568 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNA21P01568 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNA21P01568 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNA21P01568 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNA21P01568 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms