Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
GABARAPO95166 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABARAPO95166 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABARAPO95166 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABARAPO95166 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GABARAPO95166 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABARAPO95166 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABARAPO95166 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABARAPO95166 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABARAPO95166 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABARAPO95166 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABARAPO95166 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABARAPO95166 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABARAPO95166 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABARAPO95166 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GABARAPO95166 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABARAPO95166 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABARAPO95166 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABARAPO95166 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABARAPO95166 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABARAPO95166 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABARAPO95166 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABARAPO95166 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABARAPO95166 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABARAPO95166 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABARAPO95166 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GABARAPO95166 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABARAPO95166 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABARAPO95166 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABARAPO95166 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABARAPO95166 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABARAPO95166 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABARAPO95166 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABARAPO95166 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABARAPO95166 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABARAPO95166 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABARAPO95166 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABARAPO95166 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GABARAPO95166 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABARAPO95166 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABARAPO95166 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABARAPO95166 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABARAPO95166 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABARAPO95166 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GABARAPO95166 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GABARAPO95166 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GABARAPO95166 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABARAPO95166 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABARAPO95166 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABARAPO95166 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABARAPO95166 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABARAPO95166 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABARAPO95166 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABARAPO95166 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms