Protein–RNA interactions for Protein: O60423

ATP8B3, Phospholipid-transporting ATPase IK, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B3O60423 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP8B3O60423 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP8B3O60423 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP8B3O60423 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP8B3O60423 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP8B3O60423 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP8B3O60423 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP8B3O60423 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP8B3O60423 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP8B3O60423 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP8B3O60423 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP8B3O60423 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP8B3O60423 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP8B3O60423 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP8B3O60423 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP8B3O60423 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP8B3O60423 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP8B3O60423 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP8B3O60423 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP8B3O60423 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP8B3O60423 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP8B3O60423 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP8B3O60423 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP8B3O60423 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP8B3O60423 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP8B3O60423 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP8B3O60423 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP8B3O60423 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP8B3O60423 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP8B3O60423 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP8B3O60423 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP8B3O60423 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP8B3O60423 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP8B3O60423 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP8B3O60423 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP8B3O60423 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP8B3O60423 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP8B3O60423 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP8B3O60423 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP8B3O60423 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP8B3O60423 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP8B3O60423 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP8B3O60423 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP8B3O60423 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP8B3O60423 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP8B3O60423 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP8B3O60423 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP8B3O60423 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP8B3O60423 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP8B3O60423 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP8B3O60423 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP8B3O60423 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP8B3O60423 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP8B3O60423 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP8B3O60423 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP8B3O60423 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP8B3O60423 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP8B3O60423 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP8B3O60423 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP8B3O60423 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP8B3O60423 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP8B3O60423 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP8B3O60423 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP8B3O60423 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP8B3O60423 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP8B3O60423 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP8B3O60423 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP8B3O60423 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP8B3O60423 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP8B3O60423 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms