Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMARCA5O60264 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms