Protein–RNA interactions for Protein: O60240

PLIN1, Perilipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN1O60240 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PLIN1O60240 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PLIN1O60240 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PLIN1O60240 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PLIN1O60240 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PLIN1O60240 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PLIN1O60240 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PLIN1O60240 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PLIN1O60240 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PLIN1O60240 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PLIN1O60240 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PLIN1O60240 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PLIN1O60240 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PLIN1O60240 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PLIN1O60240 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PLIN1O60240 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PLIN1O60240 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PLIN1O60240 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PLIN1O60240 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PLIN1O60240 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PLIN1O60240 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PLIN1O60240 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PLIN1O60240 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PLIN1O60240 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PLIN1O60240 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PLIN1O60240 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PLIN1O60240 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PLIN1O60240 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PLIN1O60240 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PLIN1O60240 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PLIN1O60240 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PLIN1O60240 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PLIN1O60240 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PLIN1O60240 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PLIN1O60240 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PLIN1O60240 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PLIN1O60240 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PLIN1O60240 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PLIN1O60240 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PLIN1O60240 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PLIN1O60240 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PLIN1O60240 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PLIN1O60240 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PLIN1O60240 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PLIN1O60240 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PLIN1O60240 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PLIN1O60240 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLIN1O60240 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLIN1O60240 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLIN1O60240 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLIN1O60240 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLIN1O60240 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PLIN1O60240 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLIN1O60240 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLIN1O60240 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLIN1O60240 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLIN1O60240 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLIN1O60240 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PLIN1O60240 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLIN1O60240 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PLIN1O60240 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PLIN1O60240 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PLIN1O60240 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PLIN1O60240 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PLIN1O60240 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PLIN1O60240 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PLIN1O60240 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PLIN1O60240 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PLIN1O60240 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PLIN1O60240 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PLIN1O60240 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PLIN1O60240 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PLIN1O60240 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PLIN1O60240 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PLIN1O60240 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PLIN1O60240 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PLIN1O60240 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PLIN1O60240 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PLIN1O60240 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLIN1O60240 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLIN1O60240 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLIN1O60240 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLIN1O60240 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLIN1O60240 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLIN1O60240 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLIN1O60240 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLIN1O60240 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLIN1O60240 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLIN1O60240 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLIN1O60240 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLIN1O60240 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLIN1O60240 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLIN1O60240 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLIN1O60240 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PLIN1O60240 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PLIN1O60240 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PLIN1O60240 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PLIN1O60240 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PLIN1O60240 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PLIN1O60240 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms