Protein–RNA interactions for Protein: O43920

NDUFS5, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS5O43920 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NDUFS5O43920 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NDUFS5O43920 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NDUFS5O43920 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
NDUFS5O43920 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NDUFS5O43920 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NDUFS5O43920 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NDUFS5O43920 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NDUFS5O43920 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NDUFS5O43920 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NDUFS5O43920 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NDUFS5O43920 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NDUFS5O43920 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NDUFS5O43920 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NDUFS5O43920 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NDUFS5O43920 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
NDUFS5O43920 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
NDUFS5O43920 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NDUFS5O43920 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NDUFS5O43920 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NDUFS5O43920 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NDUFS5O43920 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NDUFS5O43920 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NDUFS5O43920 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NDUFS5O43920 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NDUFS5O43920 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NDUFS5O43920 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NDUFS5O43920 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NDUFS5O43920 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NDUFS5O43920 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NDUFS5O43920 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NDUFS5O43920 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NDUFS5O43920 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NDUFS5O43920 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NDUFS5O43920 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NDUFS5O43920 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NDUFS5O43920 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NDUFS5O43920 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NDUFS5O43920 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NDUFS5O43920 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NDUFS5O43920 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NDUFS5O43920 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NDUFS5O43920 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NDUFS5O43920 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NDUFS5O43920 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NDUFS5O43920 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NDUFS5O43920 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NDUFS5O43920 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NDUFS5O43920 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NDUFS5O43920 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NDUFS5O43920 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NDUFS5O43920 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NDUFS5O43920 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NDUFS5O43920 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NDUFS5O43920 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NDUFS5O43920 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NDUFS5O43920 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
NDUFS5O43920 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NDUFS5O43920 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NDUFS5O43920 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NDUFS5O43920 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NDUFS5O43920 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NDUFS5O43920 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NDUFS5O43920 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NDUFS5O43920 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NDUFS5O43920 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NDUFS5O43920 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NDUFS5O43920 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NDUFS5O43920 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NDUFS5O43920 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NDUFS5O43920 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
NDUFS5O43920 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NDUFS5O43920 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NDUFS5O43920 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NDUFS5O43920 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NDUFS5O43920 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NDUFS5O43920 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NDUFS5O43920 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NDUFS5O43920 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NDUFS5O43920 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NDUFS5O43920 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NDUFS5O43920 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NDUFS5O43920 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NDUFS5O43920 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NDUFS5O43920 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NDUFS5O43920 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NDUFS5O43920 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NDUFS5O43920 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NDUFS5O43920 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NDUFS5O43920 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NDUFS5O43920 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NDUFS5O43920 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NDUFS5O43920 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NDUFS5O43920 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NDUFS5O43920 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NDUFS5O43920 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NDUFS5O43920 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
NDUFS5O43920 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NDUFS5O43920 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NDUFS5O43920 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms