Protein–RNA interactions for Protein: O43272

PRODH, Proline dehydrogenase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRODHO43272 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRODHO43272 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PRODHO43272 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRODHO43272 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRODHO43272 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PRODHO43272 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PRODHO43272 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PRODHO43272 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PRODHO43272 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRODHO43272 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRODHO43272 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PRODHO43272 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRODHO43272 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRODHO43272 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRODHO43272 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRODHO43272 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRODHO43272 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PRODHO43272 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PRODHO43272 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
PRODHO43272 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
PRODHO43272 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PRODHO43272 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRODHO43272 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PRODHO43272 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PRODHO43272 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRODHO43272 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PRODHO43272 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRODHO43272 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRODHO43272 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PRODHO43272 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRODHO43272 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRODHO43272 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRODHO43272 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRODHO43272 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PRODHO43272 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRODHO43272 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRODHO43272 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRODHO43272 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRODHO43272 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRODHO43272 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRODHO43272 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRODHO43272 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRODHO43272 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRODHO43272 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRODHO43272 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRODHO43272 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRODHO43272 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRODHO43272 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRODHO43272 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRODHO43272 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PRODHO43272 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRODHO43272 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRODHO43272 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRODHO43272 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRODHO43272 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRODHO43272 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRODHO43272 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRODHO43272 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRODHO43272 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRODHO43272 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRODHO43272 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRODHO43272 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRODHO43272 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRODHO43272 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRODHO43272 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRODHO43272 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRODHO43272 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRODHO43272 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRODHO43272 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRODHO43272 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRODHO43272 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRODHO43272 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRODHO43272 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PRODHO43272 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRODHO43272 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRODHO43272 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRODHO43272 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRODHO43272 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRODHO43272 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRODHO43272 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRODHO43272 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRODHO43272 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRODHO43272 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRODHO43272 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRODHO43272 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRODHO43272 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRODHO43272 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRODHO43272 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRODHO43272 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRODHO43272 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRODHO43272 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRODHO43272 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRODHO43272 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRODHO43272 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRODHO43272 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRODHO43272 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRODHO43272 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRODHO43272 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRODHO43272 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRODHO43272 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms