Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RGPD3A6NKT7 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RGPD3A6NKT7 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RGPD3A6NKT7 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RGPD3A6NKT7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RGPD3A6NKT7 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RGPD3A6NKT7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RGPD3A6NKT7 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RGPD3A6NKT7 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RGPD3A6NKT7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RGPD3A6NKT7 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RGPD3A6NKT7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RGPD3A6NKT7 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RGPD3A6NKT7 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RGPD3A6NKT7 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RGPD3A6NKT7 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RGPD3A6NKT7 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RGPD3A6NKT7 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RGPD3A6NKT7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RGPD3A6NKT7 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RGPD3A6NKT7 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RGPD3A6NKT7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RGPD3A6NKT7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RGPD3A6NKT7 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RGPD3A6NKT7 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RGPD3A6NKT7 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RGPD3A6NKT7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RGPD3A6NKT7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RGPD3A6NKT7 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RGPD3A6NKT7 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RGPD3A6NKT7 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RGPD3A6NKT7 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RGPD3A6NKT7 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RGPD3A6NKT7 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RGPD3A6NKT7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RGPD3A6NKT7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RGPD3A6NKT7 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RGPD3A6NKT7 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RGPD3A6NKT7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RGPD3A6NKT7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RGPD3A6NKT7 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RGPD3A6NKT7 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RGPD3A6NKT7 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RGPD3A6NKT7 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RGPD3A6NKT7 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RGPD3A6NKT7 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RGPD3A6NKT7 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RGPD3A6NKT7 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RGPD3A6NKT7 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RGPD3A6NKT7 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RGPD3A6NKT7 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RGPD3A6NKT7 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RGPD3A6NKT7 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RGPD3A6NKT7 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RGPD3A6NKT7 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RGPD3A6NKT7 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RGPD3A6NKT7 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RGPD3A6NKT7 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RGPD3A6NKT7 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RGPD3A6NKT7 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RGPD3A6NKT7 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RGPD3A6NKT7 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RGPD3A6NKT7 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RGPD3A6NKT7 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RGPD3A6NKT7 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RGPD3A6NKT7 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RGPD3A6NKT7 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RGPD3A6NKT7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RGPD3A6NKT7 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RGPD3A6NKT7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RGPD3A6NKT7 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RGPD3A6NKT7 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RGPD3A6NKT7 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RGPD3A6NKT7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RGPD3A6NKT7 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RGPD3A6NKT7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RGPD3A6NKT7 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RGPD3A6NKT7 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RGPD3A6NKT7 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RGPD3A6NKT7 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RGPD3A6NKT7 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RGPD3A6NKT7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RGPD3A6NKT7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RGPD3A6NKT7 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RGPD3A6NKT7 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RGPD3A6NKT7 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RGPD3A6NKT7 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RGPD3A6NKT7 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RGPD3A6NKT7 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RGPD3A6NKT7 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RGPD3A6NKT7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RGPD3A6NKT7 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RGPD3A6NKT7 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RGPD3A6NKT7 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RGPD3A6NKT7 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms