Protein–RNA interactions for Protein: A6NF36

CCDC182, Coiled-coil domain-containing protein 182, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC182A6NF36 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC182A6NF36 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC182A6NF36 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC182A6NF36 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC182A6NF36 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC182A6NF36 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC182A6NF36 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC182A6NF36 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC182A6NF36 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC182A6NF36 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC182A6NF36 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC182A6NF36 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC182A6NF36 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC182A6NF36 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC182A6NF36 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC182A6NF36 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC182A6NF36 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC182A6NF36 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC182A6NF36 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC182A6NF36 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC182A6NF36 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC182A6NF36 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC182A6NF36 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC182A6NF36 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC182A6NF36 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC182A6NF36 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC182A6NF36 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC182A6NF36 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC182A6NF36 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC182A6NF36 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC182A6NF36 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC182A6NF36 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC182A6NF36 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC182A6NF36 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC182A6NF36 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC182A6NF36 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC182A6NF36 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC182A6NF36 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC182A6NF36 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC182A6NF36 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC182A6NF36 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC182A6NF36 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC182A6NF36 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC182A6NF36 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC182A6NF36 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC182A6NF36 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC182A6NF36 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC182A6NF36 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC182A6NF36 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC182A6NF36 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC182A6NF36 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC182A6NF36 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC182A6NF36 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC182A6NF36 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC182A6NF36 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC182A6NF36 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC182A6NF36 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC182A6NF36 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms